Оригинал статьи представлен на colby.edu.

Тексты: Тимоти Д. В. Кларидж (Timothy D. W. Claridg), NMR методы высокого разрешения в органической химии, 2-я редакция. Pergamon, Oxford, 2009.

Д. Л. Павия, Г. М. Лампман, Г. С. Криз-младший, Введение в спектроскопию: руководство для студентов органической химии, 3-е. издание. Б. У. Сондерс, Филадельфия, Пенсильвания, 2001.

Учебный план

NMR -спектроскопия

JCAMP NMR и ИК-спектральный дисплей (Internet Explorer, Safari и Chrome)

Постоянный заместительный подход H химического прогноза сдвига для протонных химических сдвигов.

Прогноз химического переноса. Подход к заменителю константы для химического переноса протона (Java зависимая версия)

Предсказание константы соседней спин-спиновой связи для уравнения Альтона для констант 1H-1H 3J в алканах (sp3-sp3).

Винильное и аллильное спин-спиновое взаимодействие константы Карплуса Прогнозирования уравнений 1H-1H 3J винила и 4J аллильные константы алкенов (с пакетом обновления SP2-SP3).

JMM: Первый старый мультиплицированный маркер для мультиплетов спин-спинового расщепления (или, JMM: альтернативная версия без кадров или оценка J)

JJ: Деконволюция спин-спинового Мультиплета 1-го порядка для определения констант связи J из мультиплетов спин-спинового расщепления 1H NMR (в разработке)

Деконволюции: NMR спектральная деконволюция и пик для автоматических пиков на основе преобразования спектральной деконволюции Фурье. Этот апплет полезен для создания списка пиков для спин-спинов JJ на основе мультиплета деконволюции, смотрите выше.

JD: моделирование спин-спин расщепления до шести спинов. [Старая версия Java для построения графиков: JD (требуется Java)]

Обмен: имитация формы линии химического обмена для обмена 2 мест. Если вы не хотите использовать версию DHTML, используйте Exchange (графика низкого разрешения).

Масс-спектрометрия

Искатель фрагментов находит возможные формулы, соответствующие заданной молярной массе. Затем вычисляются соотношения M+1 и M+2 и точные массы каждого из возможных фрагментов.

Искатель формул находит возможные формулы, соответствующие заданной молярной массе и нескольким фрагментам. Затем вычисляются соотношения M+1 и M+2 и точные массы каждого из возможных фрагментов.

Искатель молярной массы угадывает возможные молекулярные массы иона, если ваш спектр не мог иметь молекулярный пик Иона. Если список пиковых значений представлен в виде текстового файла на диске HP ChemStation, его можно загрузить в апплет MolarMass.

Изотопный кластер вычисляет изотопную картину для данной молекулярной формулы. Она включает в себя 3-й и 4-й период репрезентативных и переходных металлических элементов.

Молярная масса вычисляет молярную массу и изотопную картину для данной молекулы, указанной в формате Smiles.

Искатель массы трипептида ищет ионы Ди-или трипептида, которые соответствуют заданной массе.

Массовый искатель пептида высчитывает массы ионов для тех, которые дали последовательности пептида. Можно также построить график изотопного кластера для Иона. Этот апплет позволяет стабильное замещение изотопа для аминокислоты с переменным составом для нормальной и замещенной формы.

Искатель растворителя кластерных ионов находит формулу растворителя для кластерных ионов на фоне электроспрея при ионизации MS.

Искатель комплекса металла находит формулу для неорганического комплекса.

Искатель массы пентаолигонуклеотида — ищет Ди — Пента – и олигонуклеотидные ионы, которые соответствуют данной массе для заряда, m/z.

Кросслинкер находит все возможные перекрестные связи, усваивает протеины, и перечисляет моноизотопическую массу каждого перекрестного пептида.

Инфракрасная спектроскопия

IR Помощник – это пошаговое руководство по интерпретации инфракрасных спектров. (Internet Explorer и теперь работает с Safari!)

Это новая версия. Если у вас есть проблемы с новой версией, пожалуйста, свяжитесь с нами по электронной почте [email protected]

Исследователь спектра ИК показывает JCAMP форматированный спектр ИК и выделяет зоны функциональной группы для помощи интерпретации. (Internet Explorer, Safari и Chrome)

Попробуйте также IR Spectrum Explorer (Small) для небольших экранов.

Преобразование единиц измерения

Вот приложение преобразования энергии, которое должно быть полезным, особенно для преобразования Hartrees и eV к KJ / mol и соотношений Больцмана для популярций.

3D-строители молекул и расчеты молекулярной структуры

Постройте 3D-структуру молекулы и предскажите ИК-спектр:

Молекулярная механика MM3

Молекулярная механика MM3: webMM3

Колби — Webmo вычислительной химии в Интернете

Корреляционные диаграммы

Корреляционные диаграммы NMR 

Симулятор HPLC

Симулятор HPLC использует чисто модели уравновешения хромотографии для того чтобы сымитировать разъединение двух смесей. Константы равновесия и коэффициенты разбиения могут быть установлены для всех комплексов, которые формируются, включая димеры. Подвижная фаза может иметь присадку M, которая может быть циклодекстрином, реагентом ионного спаривания и прочее. Обнаружение может быть прямым или косвенным, используя добавку подвижной фазы. Внимание: этот JavaScript занимает много времени для запуска. Колонка 100 требует sec 20. на очень быстром компьютере. Этот сценарий выполняется с помощью Netscape и Internet Explorer на компьютерах Mac и ПК.

Запрограммированный имитатор HPLC работает быстрее и позволяет разбавителю мобильной фазы быть запрограммированным, т. е. пульсированным, так, что вы сможете сделать некоторые интересные определения константы уравновешения. Запрограммированная версия написана на FORTRAN с интерфейсом cgi, поэтому колонки с ~ 1000 или больше выполняются быстро.

Введение к имитатору HPLC обсуждает теорию и применения программы. Комментарии и предложения будут очень полезны (2/7/02).

Инструкции для инструментов

Домашняя страница инструментов Colby: инструкции и руководства пользователя

Специфика NMR

Трансформация Фурье в Javascript (Джефф Климер)

SDBS комплексная спектральная база данных для органических соединений

NMRShiftDB, спектральная база данных Института химической экологии им. Макса Планка

Sweet J приложение для Mac для вычисления констант J-связи с использованием уравнений Карплюса и Альтоны.

NMR Менделеева (Брукер eNMR)

Периодическая таблица NMR (Rider Univ.)

NMR учебник (Rider Univ.)

Домашняя страница NMR в Потсдамском университете имеет он-лайн приложения для спектральной интерпретации NMR и интерпретации масс-спектров, в том числе:

Мастер 1H: интерактивный график корреляции химического сдвига 1H

ИК мастер: интерактивный график корреляции ИК

Мастер MS: интерактивный график фрагментов MS

AROSIM расчет для химических сдвигов ароматических соединений 13C

Химические Таблицы Переноса

Константы связи диапазонов nJ (H,H)- константы связи

NMR-растворители: обзор распространенных растворителей в NMR-спектроскопии

Проблемы cпектроскопии

Проблемы органической спектроскопии Университета Колорадо (с ответами).

UCLA Webspectra (с ответами).

Нотр-Дам: Книга неизвестных

Проводной Химик

Учебные пособия по NMR

NMR учебник (Университет Райдера.)

Введение в NMR UWI-Mona

Приложения NMR -спектроскопии 1H (Р. Хальпап, Г. Хёндель)

Виртуальный учебник органической химии (В. Реуш, Университет Мичигана.)

Введение в масс-спектрометрию Б. М. Тишшье, Университет Вермонта

Введение в масс-спектрометрию Л. Бреци, Университет Аризоны

Общая Спектроскопия

Национальный институт стандартов и технологии. Химическая веб-книга включает в себя термохимические и газовые фазы ИК и масс-спектральные данные.

Интерактивный график IR Wizard IR Корреляции

Интерактивный график MS Wizard MS Фрагмент

Поиск в базе данных органических соединений по критериям на основе информации масс-спектрометрии, УФ/видимого поглощения и функциональных групп.

Программа поиска NIST MS для Windows имеет очень полезные приложения MS интерпретации.

Молекулярная механика и графика

Домашняя страница RasMol является источником для приложений и информации RasMol/RasMac.

Учебник по молекулярной механике колледжа Колби для введения в молекулярную механику и для вычислительных упражнений с использованием молекулярной механики и динамики с использованием МО.

Молекулярная структура

База данных ChemSpider — структура поиска и расширений.

Банк белковых данных RCSB представляет собой хранилище рентгеновских и NMR 3D-структур белков и нуклеиновых кислот.

Расчеты молекулярной структуры в Колби с использованием теории функционала плотности.

Общие ссылки

ChemInfo в Университете Индианы поможет вам найти и узнать, как использовать химические информационные ресурсы в интернете и в других местах.

Многие дополнительные ресурсы доступны на веб-сайте курса физической химии Colby.

Для получения дополнительных сведений или исправлений следует связаться с Томом Шаттак по адресу [email protected]